Historisch gesehen wurde Chateau Margaux bereits im 15. Jahrundert urkundlich erwähnt. Genau kann man das Datum allerdings nicht fixieren, allerdings lagen die Besitztümer zwischen 1572 und 1582 bei Pierre de Lestonnac. Durch eine Heirat im Jahre 1654 kam Chateau Margaux an die Bordelaiser Familie Pontac, welcher zu dieser Zeit auch die Eigentumsverhältnisse von Chateau haut Brion leitete. Eine schwierige Zeit erlebte das bis dahin sehr kontinuierlich geführte Gut während der Zeit der französischen Revolution. Chateau Margaux wurde beschlagnahmt um dann kurze Zeit später von einer der letzten Erbin der Familie mit Glück und Geschick zurückgekauft werden konnte. Getrieben durch die Schuldenlast ging das Gut Margaux dann im Jahre 1804 an den Baske Colonilla, welcher auch 1816 das prunkvolle und bekannte Chateau Margaux in der heutigen Gestalt.